元始の大杉神社は縄文時代に端を発する「あんばさま」を祀ることところみ起因します。

奈良時代の神護景雲元年(767)勝道上人は、疫病に苦しむ人々を救済するため巨杉に祈念し、 三輪明神（倭大物主櫛甕玉大神・大己貴大神・少彦名大神）が飛来鎮座したと伝えられます。

以降、疫病をはじめあらゆる厄難から救済する神として 「悪魔祓のあんばさま」と称されるようになったといいます。

平安時代の末から常陸坊海存(ひたちぼうかいぞん)が社僧を務め、 数々の奇跡を起こしたと伝わります。 文治五年(1189)に忽然と姿を隠した海存は、 巨体・紫髭・碧眼・鼻高という容貌から 大杉大明神の眷属である天狗とされたといいます。

摂社：大国神社(おおくにじんじゃ)：大己貴大神(おおなむちのおおかみ)・事代主大神(ことしろぬしのおおかみ)

末社：勝馬神社(かちうまじんじゃ)：不詳(一般に安馬さま)

• 最勝立身出世稲荷神社(さいしょうりっしんしゅっせいなりじんじゃ)：宇迦之御魂大神(うかのみたまのおおかみ)
• 相生神社(あいおいじんじゃ)：伊弉諾大神(いざなぎのおおかみ)・伊弉冉大神(いざなみのおおかみ)
• 捄総社(くぞうしゃ・ふさのすべやしろ)
• 日祀社(ひまつりしゃ)：日女大神(ひるめのおおかみ)
• 鵜神社(うなかみしゃ)：鵜神大神(うなかみのおおかみ)
• 梶鳥社(かじとりしゃ)：鳥船大神(とりふねのおおかみ)
• 神護社(じんごしゃ)：日奉部直神護命(ひまつりべのあたいじんごのみこと)
• 雪隠神(せっちんがみ)：不詳
• 五十瀬神社(いそせじんじゃ)：天照大御神(あまてらすおおみかみ)
• 日吉山王宮・白山神社・妙見宮 合祀社
• 日吉山王宮(ひえさんのうぐう)：大己貴神(おおなむちのかみ)・大山咋神(おおやまぐいのかみ)
• 白山神社(はくさんじんじゃ)：白山比咩神(はくさんひめのかみ)
• 妙見宮(みょうけんぐう)：天御中主神(あめのみなかみのかみ)
• 四柱神社(よはしらじんじゃ)
• 天御中主神(あめのみなかみぬしのかみ)・高皇産霊神(たかみむすひのかみ)・神皇産霊神(かみむすひのかみ)・天照<大御神(あまてらすおおみかみ)
• 神直日神(かんなおひのかみ)・大直日神(おおなおひのかみ)
• 天満宮(てんまんぐう)：菅原道真公(すがわらみちざねこう)
• 葦船神社(あしふねじんじゃ)：大国主大神(おおくにぬしのおおかみ)・事代主大神(ことしろぬしのおおかみ)・此社坐幼霊(このやしろにますおさなごのみたま)